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En Auvergne, le réseau hydrographique couvre une grande diversité de types d’eaux courantes, dans laquelle les conditions de vie évoluent de l’amont vers l’aval [1],

On distingue ainsi :

Les zones de source et ruisselets des zones de massifs montagneux (Cantal et Mont-Dore), dans ces zones les cours d’eau sont caractérisés par une pente forte et des eaux très froides où la faune et la flore sont peu présentées.

Les cours d’eau salmonicoles et vallées glaciaires des plateaux (le Cézallier), ce sont des cours d’eau avec une pente faible et des températures froides. Le peuplement piscicole est essentiellement assuré par la truite, accompagnée par le chabot et le vairon. C’est également une zone refuges pour l’Ecrevisse à pattes blanches ou la Moule Perlière. Les larves d’insectes qui dominent sont des Plécoptères, des Ephémères, des Trichoptères, des Diptères et des Coléoptères.

La Couze d’Ardes

Lignon au Seuils

Les petits cours d’eau torrentueux des zones de rupture de pentes. Ces cours d’eau appartiennent également au domaine salmonicole, et correspondant aux petites rivières aux eaux fraîches. Les invertébrés aquatiques présents dans ce type de cours d’eau ont des adaptations anatomiques leur permettant de lutter contre la force du courant : les larves d’Ephémères avec un corps applati, des larves de Trichoptères ou des Simulidae avec des « crochets ». D’autres invertébrés construisent des abris comme certaines larves de Trichoptères à fourreau.

Allier à Langogne

Les grandes rivières salmonicoles correspondant aux grandes zones de gorges de l’Allier, la Loire, la Dore, la Sioule et la Dordogne. Ces cours d’eau sont caractérisés par une largeur importante et une pente forte. Le peuplement piscicole est dominé par la truite, l’ombre commun, le saumon, le barbeau, la vandoise et certaines espèces d’accompagnement comme le chabot, le goujon et le vairon, Ce type de milieu joue un rôle important comme zone refuge d’espèces (saumon atlantique, lamproie de planer, et comme zone de reproduction du saumon.

Eau Mère

Les petits cours d’eau des plaines situés dans le bocage bourbonnais, les forêts de Tronçais où de Randan, sont caractérisés par une faible largeur et vitesse de courant modérée. Ils présentent des fonds constitués de sédiments fins (limons, sables et graviers), et une température des eaux élevées. Ces cours d’eau accueillent une grande diversité de poissons.

La Sioule à Contigny

Les zones alluviales des grands cours d’eau, c’est-à-dire le val d’Allier, le val de Loire. Ces milieux sont caractérisés par une largeur importante, une pente faible, des températures élevées et une installation de la végétation. Une grande diversité d’espèces habite ces eaux. On peut citer en particulier le Brochet, la Bouvière, le Toxostome, la Lamproie marine, la Lamproie fluviatile, la Mulette épaisse.
Une grande diversité de macrofaune benthique avec une biomasse importante est également présente : des Ephémères, des larves de Trichoptères, des Diptères, des Coléoptères, des Plécoptères, des mollusques. Les larves de Libellules sont très abondantes et diversifiées : Calopteryx, Plactynemis, Gomphus...

[1] D’après « Diagnostic de la Biodiversité en Auvergne » Décembre 2009